中国科学院自动化研究所医学影像研究室，成立于1996年，是一个团结进取、朝气蓬勃、奋发向上的年轻集体。在创建人――留美归来的博士后田捷研究员的带领下，经过十多年的发展，已取得显著科研成果。

    本室的研究工作主要围绕着结构成像，功能成像，分子影像相关基础理论及平台的研发和推广应用展开，着重以提高医学适用计算机的辅助诊断与治疗的准确性和可靠性，使人们借助影像设备对病变区域的观察，看得更清，看得更准，看得更早。

    在理论成果方面，研究组已在NeuroImage, Academic Radiology，Magnetic Resonance Imaging，Optics Express,Physics in Medicine and Biology, Communications in Numerical Methods in Engineering, Journal of X-ray Science and Technology，软件学报，自然科学进展等国内外知名学术期刊以及国际主流会议上发表相关论文百余篇，其中SCI/EI检索一百余篇，并获2003年度国家科技进步二等奖，出版了专著《医学影像处理与分析》,《集成化医学影像算法平台理论与实践》 和《医学影像算法设计与平台构建》。已授权和申请专利40余项。

    在关键技术突破方面，在医学影像关键算法的研究基础上，重点关注医学影像分割、配准、三维可视化、功能图像后处理及分子影像领域，并研发医学影像处理算法集成平台，实现了一个具有一致接口的，包含医学影像可视化、分割、配准及分子影像算法，支持跨平台和跨编译器研发的、集成化的算法研发平台MITK和可扩展的集成平台3DMED。该平台目前已向教育和研究机构免费提供，可在网站下载试用，已引起美国、法国、德国、日本等研究机构的广泛关注，国内外用户累计下载量至今已超过10000次。

    在典型应用方面，课题组的研究成果不仅用于301医院、北京肿瘤医院、天坛医院等医院，还在国产医疗设备如广东威尔的数字三维超声工作中得到应用，实现实时三维超声图像重建及可视化；另外，还用于航空和航天等国家重点攻关项目中，如医学影像在运载火箭和战略导弹的研制中的应用，以及与国防科工委合作，应用三维断层图像处理与分析技术，研究者可以进行精密工件内部结构的测量以及缺陷的无损检测，进行大数据量工业CT图像处理、分析及三维重建，以及各种材料的成分和结构分析等。

     研究室承担的项目包括：国家重点基础研究发展计划（973计划）、国家杰出青年科学基金、国家自然科学基金重大项目、973基础研究重大项目前期研究专项(2004)、国家自然科学基金面上项目、中国科学院重大科研装备研制项目、以及国家级重点工程应用项目等。研究室还为国家和社会培养了大批优秀的高级人才，他们获得的殊荣有院长奖学金特别优秀奖、国家教委百篇优秀论文奖、中科院百篇优秀博士论文奖、华为奖学金一等奖等。目前，有在读博士研究生18人，在读硕士研究生3人。